ANAEROBNI BAKTERIJ je onaj, koji se može razmnažati samo, gdje nema slobodnog kisika, za razliku od aerobnog bakterija, koji uvijek traži slobodni kisik iz zraka. Postojanje takvih anaerobnih bakterija međutim nije u protuslovlju s općim biološkim zakonom, da bez kisika nema života; i a. b. trebaju kisik, ali ne mogu živjeti od slobodnog kisika u zraku, već od kisika kemijski vezanog uz hranu. A. b. javljaju se u prirodi kod rastavljanja organskih tvari, kod t. zv. truljenja, kod kojega se razvijaju plinovi neugodna mirisa. Bakteriji, koji mogu živjeti jednako kod aerobnih kao i kod anaerobnih uvjeta, zovu se fakultativni anaerobi (od grč. an »ne«, aer »zrak«, bios »život«).